选择跨专业考研时，机械电子工程专业的同学可以考虑以下几类方向深造：

首先，推荐的是CAE专业，即有限元分析类。该专业对数学能力、拓扑设计、优化设计以及物理分析能力有较高要求，是需要进一步深造的专业。

其次，工业机器人专业也值得关注。大学本科所学知识无法满足工业机器人的学习和设计需求。工业机器人学科综合性较强，涵盖了力学、自动化、机械原理、动设备制造等多个领域，涉及使用空间、操作空间等具体问题，因此可以根据自身需求选择深造。

再者，车辆设计专业也是值得考虑的领域。本科阶段虽然可以完成一些基础学习，但要在企业中担任较好的职位，通常需要研究生学历。汽车设计领域对高知识、高学历的人才需求较高，研究生学历在汽车研发等职位上更具竞争优势。