华清学院提供医学专业课程。清华大学医学院成立于2001年，由著名医学科学家、两院院士吴阶平教授担任首任院长，赵南明教授、施一公院士、鲁白教授和董晨教授先后担任常务副院长，2016年9月董晨教授成为医学院院长。

清华大学的医学专业包括本科层次和研究生层次。本科层次的专业涉及广泛的医学领域。研究生层次医学专业有临床医学（内科学、外科学、神经外科、妇产科学、耳鼻咽喉科学、全科医学、神经病学、康复医学与理疗学、重症医学、皮肤病与性病学、麻醉学、影像医学与核医学），生物医学工程和公共卫生等。

清华大学医学院设有基础医学系、临床医学院、生物医学工程系和公共健康研究中心，涵盖了分子与细胞生物学、免疫学、肿瘤生物学、传染病学、神经科学、生物医学工程学、公共健康学与临床医学等八大专业学科。