在福建医科大学，大二上学期的课程安排包括生理学、生物化学、医学伦理学、医学心理学、马克思英语3或英语4。这些课程旨在为学生提供全面的基础医学知识和人文素养。

到了大二下学期，学生将学习医学免疫学、医学微生物学、医学寄生虫学以及病理生理学。此外，还会涉及到毛概、卫生法和职业生涯规划等课程。这些课程进一步深化了学生的医学专业技能，同时关注学生的个人发展。

进入大三，学生的主要学习方向将转向更为专业的医学领域。剩余的课程包括病理学、局部解剖学机能学、预防医学等四大科目。这些课程将帮助学生深入了解疾病的发生机制，掌握预防疾病的策略，为未来的临床实践打下坚实的基础。

这些课程的设置旨在全面提升学生在医学领域的专业知识和技能，同时也注重培养学生的综合素质和职业素养。