在选择学校时，五邑大学和惠州学院各有特点。五邑大学拥有13个硕士研究生专业，是一个以本科和研究生教育为主的学校，早在几年前就已经停止招收大专生。相比之下，惠州学院则是一个同时进行本专科教育的学院，尽管在几年前才开始本科教育，但现在仍然是本专科并重的学校。在学术地位和教学实力方面，五邑大学明显高于惠州学院一个层次。

从经济角度来看，江门市主要依赖本地的民营经济，虽然近几年的发展速度不如惠州，但基础条件更为扎实，居民收入水平较高，存款总额比惠州高出三分之一。而惠州则主要依靠外来投资，城市经济繁荣，但县镇地区的经济发展相对较弱，贫富差距较大，富人多为外来投资带来的经济收益。

因此，在选择学校时，如果重视学术研究和研究生教育，五邑大学是更好的选择。而如果更看重本科学历教育，或者对本地经济和就业市场有一定了解，惠州学院可能更适合。

综上所述，五邑大学和惠州学院在学术层次和经济背景上存在差异，学生在选择时应根据个人需求和目标做出决定。