在选择会计专业和审计硕士时，南京财经大学的会计专业和南京审计学院的审计硕士各有特色。从综合评价来看，南京财经大学的会计专业显得更为优势，而南京审计学院的审计硕士则因其独特的背景和教学质量，在行业内享有更高的声誉。

南京审计学院作为审计署直属的高校，其审计学专业的设立得到了教育部的特别批准，这使得其在审计领域具有显著的优势。虽然现在已经有其他学校开设审计学专业，但在教学质量、学术影响力方面，南京审计学院仍然处于领先地位。

这种优势使得南京审计学院在审计领域形成了某种程度上的“垄断”，其专业水准得到了广泛的认可。这不仅体现在学术研究上，也体现在毕业生的职业发展上，南京审计学院的毕业生在审计领域往往更容易获得心仪的工作机会。

综上所述，南京财经大学的会计专业在综合竞争力上可能略胜一筹，而南京审计学院的审计硕士则凭借其独特的背景和卓越的教学质量，在特定领域内更具优势。