考取安徽工程大学的研究生总体难度相对容易。安徽工程大学虽不是985或211院校，但竞争强度相比其他顶尖高校要小得多。不过，对于王牌专业如机械设计制造及其自动化等，其录取难度仍有一定挑战。考研难度还体现在该校的研究生复试分数线。

以安徽工程大学生物与化学工程学院微生物学为例，其复试分数线为270分，其中单科成绩要求分别为政治/科目一39分、外语/科目二39分、科目三59分、科目四59分。同样，艺术学院设计学、生物与化学工程学院环境科学与工程、管理工程学院产业经济学、数理学院应用数学、体育学院体育人文社会学、计算机与信息学院计算机应用技术、以及建筑工程学院工业工程等专业也有各自相应的分数线要求。