北京外国语研究生入学考试中，无论选择学术硕士还是专业硕士，都需要参加第二外语考试。日语作为第二外语，在研究生考试中亦有学术硕士与专业硕士两种路径。

学术硕士的考试科目包括：政治100分、第二外语100分、基础日语150分、日汉互译150分。第二外语可以是英语。

专业硕士的考试科目为：政治100分、翻译硕士专业课100分、日语翻译基础150分、汉语写作与百科知识150分。同样，英语作为第二外语选项之一。

综上所述，北京外国语大学日语研究生入学考试中，第二外语可以是英语，学术硕士和专业硕士均需参加相关考试。考生可以根据个人情况选择最合适的路径进行备考。