工程管理专业的应届本科生在考研时，不能直接报考工程管理硕士，即不能选择125600工程管理硕士和085239工程硕士中的项目管理硕士。这是因为这些专业学位硕士的报考条件要求考生具有一定的工作经验，而应届毕业生并不符合这一条件。

不过，应届本科生可以考虑报考学术型硕士的工程管理，即可以选择1201Z1工程管理或0871Z1工程管理。此外，也可以根据自己的兴趣和职业规划，选择管理科学与工程、企业管理等相关专业。

学硕与专硕在代码、报考条件和初试科目方面都有所不同。专硕的代码中第3位数字为5，因此报考125600工程管理硕士和085239工程硕士中的项目管理硕士时，考生需要满足至少3年的工作经验要求。具体报考条件和初试科目可以参考报考学校的简章和【硕士专业目录】。

对于应届本科生来说，选择报考学术型硕士的工程管理，不仅能够获得系统的理论知识，还可以为将来的职业发展打下坚实的基础。同时，选择管理科学与工程、企业管理等相关专业，也能帮助学生更好地规划未来的职业道路。

总的来说，工程管理专业的应届本科生在考研时，可以根据自己的实际情况和职业规划，选择适合自己的专业方向。无论是学术型硕士还是专业型硕士，都能够在一定程度上提升个人的专业素养和竞争力。