培养方向不同，学习环境不同，入学难度不同，学费不同，导师制度不同。

1、专业型硕士，主要工作是针对于临床工作而言的，未来的方向就是和病人直接接触的医生，专硕又被称为临床型硕士。

2、学术型硕士，主要培养方向是该生的医学科研能力，未来的方向就是做研究，发展方向是医学科学家，该类型又被称为科研型硕士。

3、专业型硕士毕业后可以拿到毕业证，学位证、规培证。

4、学术型硕士只有毕业证和学位证，没有规培证。

5、医学学硕的学习环境大多数在实验室，只有半年的时间是临床学习。

6、医学专硕基本上三年都要在医院进行实习。

7、医学学硕的公共课一般考英语一和数学一，难度较大。

8、医学专硕的公共课一般考英语二和数学二，难度相对较低。

9、医学学硕的学费是按照国家的标准来收取的，通常一年需要8000元左右。

10、医学专硕的学费是由各个院校自主规定的，要以院校的具体规定为准。

11、医学学硕的学生通常只有一个导师。

12、医学专硕的学生有两个导师，一个理论性的导师，一个实践性的导师。