上海理工大学目前设有两所专科学校，分别为医疗器械高等专科学校以及高职学院，后者目前更名为工程技术学院。选择工程技术学院可能更为合适，原因有以下几点。

首先，工程技术学院位于总部，能够提供完整的大学生活体验，让学生更好地融入大学环境。其次，工程技术学院提供了便捷的专升本途径，专升本可以直接在学院内进行，无需额外的转学手续，这对于希望进一步提升学历的学生来说是非常有利的。

再者，工程技术学院的专业设置偏向于实践性和就业导向，特别是电气自动化、数控技术以及模具制造等专业。这些专业不仅就业前景广阔，而且市场需求量大，能够为学生提供良好的职业发展机会。即使不选择专升本，这些专业的学生也能找到满意的工作，具有很高的就业率。

综上所述，工程技术学院在地理位置、专升本便利性以及专业的实用性方面都具备明显优势，是选择上海理工大学专科专业的理想之选。