海南省农垦实验中学历任校领导，自成立以来，领导团队持续更新，致力于推动学校发展。自1987年9月起，第一任校长陈树年及校领导团队正式上任，包括党委副书记王思孔、副校长朱是侯、蔡干伦、何述义、黄就明。

1994年12月至1998年12月，朱是侯接任校长，何述义担任党委副书记、纪委书记，蔡干伦、黄就明及王伟明分别担任副校长。

1997年12月至2001年6月，王伟明成为校长并兼任党委书记，黄就明负责纪委书记、工会主席工作，蔡干伦担任副校长。

2001年6月至2002年9月，郑新周担任党委书记、副校长，黄就明主持行政全面工作，蔡干伦、王端盛及高英华、李朝汉分别担任副校长。

2002年10月至2004年10月，郑新周再次担任党委书记、副校长，黄就明主持全面行政工作，黄子贤为纪委书记、工会主席，李朝汉、高英华及杨立功分别为副校长。

2004年11月至今，现任校长王端盛主持党委、行政全面工作，黄子贤为党委副书记、纪委书记、工会主席，李朝汉、杨立功分别担任副校长。