学校部门的设立完全依据学校的规模和等级。例如，小学和高中在部门设置上有显著差异。我们以高等学府为例，学校的部门大致可分为六大部分：

1. 治理机构：包括学术委员会、学位评定委员会、校务委员会、监察委员会、教职工代表大会等。

2. 学部与院系：涵盖理学部、信息与工程科学部、人文学部、社会科学学部、经济与管理学部、医学部以及跨学科类等。

3. 研究机构：实体研究机构、科学研究基地、虚体研究机构等。

4. 职能部门：如党委办公室校长办公室、政策法规研究室、纪委办公室监察室、党委巡察办公室、内部控制管理办公室、党委组织部、党委宣传部、党委统战部、学生工作部、保卫部、保密委员会办公室、教务部、科学研究部、先进技术研究院、社会科学部、研究生院、继续教育部、人事部、财务部、国有资产管理委员会办公室、国际合作部、国内合作委员会办公室（扶贫工作办公室）、实验室与设备管理部、网络安全和信息化委员会办公室、总务部、房地产管理部、基建工程部、审计室、科技开发部、产业技术研究院、校办产业管理委员会办公室、学科建设办公室、校友工作办公室、离退休工作部、创新创业学院等。

5. 挂靠单位：包括督查室、网络安全和信息化委员会办公室、标识管理办公室、法律事务办公室、校园卡管理与结算中心、党校办公室、融媒体中心、学生就业指导服务中心、青年研究中心、学生资助中心、学生心理健康教育与咨询中心、教务长办公室等。

6. 群团组织：包括工会、团委、机关党委等。