中国农科院研究生教育学科专业构建在农科院九大学科群的基础上，以优化研究生教育学科体系为目标，实现学科间的协同发展。此体系涉及四大类学科，即农学、理学、工学、管理学，其中包含了十五个一级学科。具体到学位授权点，农科院设有七个博士学位一级学科学位授权点，包括作物学、园艺学、农业资源利用、植物保护、畜牧学、兽医学和农林经济管理；同时，有四十四个二级学科博士学位授权点。在硕士学位一级学科学位授权点方面，农科院设有八个，涵盖五十六个二级学科硕士学位授权点。此外，农科院还具备两个专业学位授权资格，进一步丰富了研究生教育的培养体系。