中国科学院沈阳自动化研究所，成立于1958年，专注于机器人、工业自动化和光电信息技术的研究与开发，享有国内外同行的瞩目。该所自1981年起招收研究生，拥有一支包括65名博士导师、107名硕士导师的导师队伍，其中不乏中国工程院院士以及科技攻关项目首席科学家、973项目首席科学家等人才。沈阳自动化所设置有5个博士培养点和8个硕士培养点，涵盖了“机械制造及其自动化”、“机械电子工程”、“控制理论与控制工程”、“检测技术与自动化装置”、“模式识别与智能系统”等专业。

中国科学院沈阳计算技术研究所，创建于1958年，是我国首批计算机科学研究机构之一。现有职工500余人，其中科技人员400余人，每年在岗博士生和硕士生导师百余人。该所承担了多项国家科技重大专项、国家科技支撑计划项目等科研任务，取得多项重大科技成果和专利，获得各级政府奖励。沈阳计算技术研究所设有国家级博士后科研工作站，是“计算机应用技术”博士学位培养点及“电子与信息”领域工程博士学位培养点，同时是“计算机科学与技术”和“软件工程”一级学科学术型硕士学位培养点，以及“计算机技术”、“软件工程”专业型学位培养点。

中国科学院沈阳应用生态研究所，成立于1954年，是以林业、土壤、植物、微生物与环境科学为基础的综合性应用生态学研究机构。2001年进入中国科学院知识创新工程试点，重点布局森林生态与林业生态工程、土壤生态与农业生态工程、污染生态与环境生态工程三大领域。该所是国务院学位委员会首批批准的博士学位点，拥有生态学、土壤学、微生物学、环境科学等博士学位点和学术型硕士学位点，以及生物工程、环境工程等专业学位点。现有在读研究生340人，设有生态学和农业资源与环境2个一级学科博士后流动站。

中国科学院金属研究所，成立于1953年，是新中国成立后中国科学院首批研究所之一，现已成为材料科学与工程领域的国内一流研究机构，是我国高性能材料研究与发展的重要基地。金属研究所还是国内材料科学领域的重要研究生培养基地，设有材料科学与工程一级学科博士研究生培养点、材料科学与工程一级学科硕士研究生培养点，包含材料物理与化学、材料学、材料加工工程、腐蚀科学与防护等二级学科博士、硕士研究生培养点，并设有材料科学与工程一级学科博士后流动站。2015年，金属研究所与中国科技大学合作共建中国科学技术大学材料科学与工程学院。