南方医科大学在职研究生国家承认学历。因为是南方医科大学在职研究生主要以非全日制研究生的方式招生，招生专业有公共卫生硕士、护理硕士、药学硕士等，学费为6万元，学制3年，平均每年学费2万元。非全日制研究生需要参加全国统考，经过初试复试后方可入学。招生是每年10月由考生自主在中国研究生招生信息网进行网上报名，12月参加考试，在职研究生报考条件是国家承认学历的应届本科毕业生及自学考试和网络教育届时可毕业本科生。