西湖大学主要招收博士生，与浙江大学、复旦大学等高校合作培养。在西湖大学获得博士授权点前，由浙江大学、复旦大学等颁发毕业证和学位证，学费参照浙大、复旦等高校标准。

浙江大学博士生收费为1万元每年。西湖大学为私立大学，所有纳入全国研究生招生计划的研究生均需缴纳学费，教育博士10万元全程，非全日制定向专业学位工程博士15万元全程，其他专业1万元每年。

对比来看，一般公立大学由于国家财政支持，学费多在4000-6000元每年，私立大学因需自筹资金，学费通常在13000-18000元每年，个别私立大学学费甚至超过20000元每年。