上海财经大学的金融学院与经济学院在某些方面存在差异，但这些差异并不像复旦和交通大学几个商学院之间的差距那样明显。许多人甚至不知道上海财经大学设有两个学院提供金融专业硕士项目。

在就业方面，两个学院的学生出去后待遇和机会都是一样的，没有明显的区别。经济学院的金融计量方向因其扎实的计量基础，在申请博士时会略占优势，尽管金融专硕专业的学生很少有人选择继续深造。

金融学院分为两个研究组，其中一个方向偏向技术类岗位，而另一个方向则相对更灵活，可以适应多种职业需求。尽管如此，大部分岗位对于两个方向的学生来说没有太大差别。

总体而言，两个学院之间的差异主要体现在研究方向和某些特定技能的培养上，但在实际就业市场中的表现基本相同。