中山大学目前拥有两个独立学院。中山大学南方学院依据教育部的相关文件创办，是全日制普通高等学校。学院于2006年经教育部正式批准，院校代码为12619。

另一所为中山大学新华学院，同样是在广东省教育厅与中山大学的共同努力下，与广东东宝集团合作创办的独立学院。新华学院涵盖了文、理、医、工、经、管、法、艺等多学科，是一所应用型、开放式的全日制普通高等院校。该学院不仅继承了中山大学的优良传统和办学理念，而且在过去十年中取得了显著的发展，现已成为穗莞两市中的一所万人高校，具有较高的知名度。

中山大学南方学院和中山大学新华学院虽由中山大学主办，但它们的毕业证书与中山大学主校区的证书有所不同。南方学院和新华学院的毕业证书是以各自学院的名称颁发，而非中山大学。

中山大学新华学院致力于不断提升自身教育质量，展望未来，将立足广东，面向全国乃至全球，力求成为全国同类独立学院中的佼佼者。学院未来的发展目标是打造一所应用型、开放性、多科性的高等教育机构。