福建工程学院正式更名时间为1952年。

福建工程学院经历了几次更名。学校溯源于1896年清末“苍霞精舍”。后历经更名、拆分与重组。主要有：1914年为福建公立专门工业学校，1938年为福建省立高级工业职业学校，1952年为福建省福州工业学校。

1953年学校分立为轻工业部福州工业学校和福州建筑工程学校，之后两校几易校名；2002年经教育部批准，福建建筑高等专科学校与福建职业技术学院合并组建福建工程学院；2013年经国务院学位委员会批准为硕士学位授权单位。

历史发展：清光绪二十二年（1896年），林纾、陈宝琛、陈璧等人在福州南台苍霞洲林纾旧居创设“苍霞精舍”。清光绪三十三年（1907年7月），绅设中西学堂更名为公立苍霞中学堂。清宣统元年（1909年7月），公立苍霞中学堂更名为福建官立中等工业学堂。

2017年12月，学校入选福建省2018-2020年博士硕士学位授予培育单位立项建设高校。2018年3月，学校入选省示范性应用型本科高校建设单位、入选福建省一流学科建设高校。