在探讨南开大学主校区与新校区的优劣时，我们需从地理位置、交通便利性和配套设施三个维度进行分析。

首先，从地理位置角度出发，主校区位于市内，相较于新校区的滨海新区校区和海河教育园区校区，其位置更为优越。市内交通网络发达，出行相对便利，无论是对于学生还是教职员工，都能更加轻松地到达目的地。

其次，交通便利性方面，主校区的区位优势明显。市内完善的交通系统使得无论是乘坐公交、地铁还是私家车，都能够迅速便捷地抵达主校区。而在新校区，尽管配套设施同样出色，但由于距离市区较远，出行方式的选择受限，可能需要更多时间来通勤。

最后，从配套设施方面考虑，两个校区均不逊色。主校区主要承担办公和研究生、留学生教育任务，而新校区则以本科生教育为主。尽管具体配置可能有所不同，但总体上，两个校区都提供了一流的教学和生活设施，满足不同学生群体的需求。

综上所述，考虑到地理位置、交通便利性和配套设施等因素，主校区在多个方面略显优势。当然，选择校区还需根据个人具体情况和需求，例如对住宿、学习环境的偏好，以及对市区与新区的适应能力等。因此，无论是主校区还是新校区，都能为学生提供高质量的教育环境和生活体验。