曲靖医学高等专科学校设有基础医学院、马克思主义学院、人文学院、继续教育学院、临床学院、护理学院、医学技术学院、药学院、公共卫生与健康管理学院、口腔学院等学院，这些学院具体名单如下，以供参考，如有变动，以学校最新公布的信息为准。

一、学院设置

教学机构

1. 基础医学院

2. 马克思主义学院

3. 人文学院

4. 继续教育学院

5. 临床学院

6. 护理学院

7. 医学技术学院

8. 药学院

9. 公共卫生与健康管理学院

10. 口腔学院

11. 中医学院

二、曲靖医学高等专科学校简介

曲靖医学高等专科学校坐落于云南省曲靖市，是国家“卓越医生教育培养计划”试点高校、云南省首批特色骨干院校建设单位、国家第二批现代学徒制试点单位。学校前身是1958年创建的曲靖卫生学校。2006年2月14日，经教育部批准，在曲靖卫生学校的基础上组建医学高等专科学校。2012年，学校被确定为云南省首批特色骨干院校建设单位。