菏泽学院设有多个专科，涵盖工、管、文、理、艺等多个学科领域。材料成型及控制工程专业，培养在材料成型技术领域具有扎实的理论基础和实践能力的高级技术人才。财务管理专业注重培养具备财务分析、决策能力和财务管理技能的专业人才。产品设计专业致力于培养具有创新思维和设计能力的设计师。电气工程及其自动化专业则培养能从事电气工程设计、研发、制造、安装、运行、管理等工作的高级工程技术人才。

动画、汉语言文学、化学、环境设计、机械电子工程、计算机科学与技术、建筑学、金融工程、劳动与社会保障、历史学、美术学、能源化学工程、人文地理与城乡规划、日语、商务英语、生物工程、生物制药、食品科学与工程、视觉传达设计、书法学、思想政治教育、特殊教育、体育教育、统计学、舞蹈学、物理学、物联网工程、物流管理、小学教育、心理学、音乐表演、音乐学、园林、园艺、自动化等专业，各具特色，旨在培养不同领域的高级专门人才。材料成型及控制工程、财务管理、产品设计、电气工程及其自动化、动画等专业，培养了大量有专业技能、适应社会需求的人才。在汉语言文学、历史学等人文社科领域，学生能深入理解传统文化与现代思想，培养人文素养。化学、生物工程、食品科学与工程等专业，注重科研与实践，培养学生解决实际问题的能力。

各专业注重理论与实践相结合，通过实习实训、科研项目、学科竞赛等多种形式，提高学生专业技能和综合素质。同时，学院还与企业、研究机构等建立紧密合作，为学生提供实习就业平台，促进学以致用，助力学生职业发展。