区别如下：

1、校区地址不同

第一校区位于南岗区学府路，第二校区位于双城区迎宾路。

2、校区包含学院不同

二校区有农牧工程、信息工程、食品药品三个学院，其余学院都是在一校区。

3、校区环境不同

二校区比较大，但是没有一校区地理位置那么好。二校区学生宿舍环境更好一些，物价便宜，宿舍四人一寝。一校区没有很大，但是所含学院多，所以学生众多，适合更好地与同学交流。