菏泽学院目前有两个校区，这是由其历史背景决定的。早在2005年，原菏泽师范学院与原菏泽医学专科学校合并，组成了现在的菏泽学院。因此，两所学校的合并导致了菏泽学院拥有两个校区。

主校区坐落于山东省菏泽市东明县，是菏泽学院的核心区域，拥有广阔的校园面积和齐全的教学设施。这里不仅承担着大部分的教学任务，还负责学院的管理与运行，为学生提供了一个良好的学习环境。

另一个校区则位于山东省菏泽市定陶区，作为分校区，它承担着一部分教学与办公任务，同时也丰富了学院的教育资源。通过两个校区的协同工作，菏泽学院能够更好地满足学生和教师的需求。

总结而言，菏泽学院共有两个校区，每个校区都有其独特的功能和职责。主校区主要负责核心的教学和管理工作，而分校区则在扩展学院资源的同时，也提高了教学的多样性和灵活性。