从学科实力、资金投入、师资力量、硬件环境、政策倾向等综合条件看，北京大学和清华大学无疑是国内最好的，但两校也并非所有学科都是国内第一的，其他一些有一级学科国家重点学科的院校，在相关领域也是很拔尖，某种程度上不亚于这两所，甚至超过这两所；

通信，最著名的是北邮

航天，最著名的是北航

石油，最著名的是中国石油大学

体育，最著名的是北体

英语，最著名的是北外、上外

俄语，最著名的是黑龙江大学

天文，最著名的是南京大学

古文，最著名的是复旦

口腔，最著名的是四川大学

传媒，最著名的是中国传媒大学

音乐，最著名的是中央音乐学院

美术，最著名的是中央美院

电影，最著名的是北影

建筑，最著名的是同济大学

火灾，最著名的是中科大

GIS，最著名的是武汉大学

法学，最著名的是中国政法

马思，最著名的是中国人大

教育，最著名的是北师大

地质，最著名的是中国地质大学

车辆，最著名的是吉林大学

冶金，最著名的是东北大学

超算，最著名的是国防科大