南通大学有三个校区，当然，第四个在建校区在启东。其中，三个校区包括：主校区在崇川区啬园路9号，中南世纪城东边。在火车站可乘41路公交车到西门，长途车站可乘8路公交车到陆洪闸，步行一会就到北门。在南大街可乘301（西门、北门）或48（到西门）。钟秀校区在外环东路，公交车有4路。启秀校区在南大街南面，即南通博物院南面，公交车有5路，53路经过。