中国海洋大学自动化专业设于工程学院。工程学院成立于1983年，前身是1980年创立的海洋工程系。学院于1993年正式成立，现已成为以海洋特色著称的高水平工科学院，注重人才培养与科研协同发展。

学院现设海洋工程系、土木工程系、机电工程系和自动化及测控系四大系，构建了全面的人才培养体系。下设8个本科专业，涵盖港口航道与海岸工程、船舶与海洋工程、土木工程、工程管理、机械设计制造及其自动化、工业设计、轮机工程及自动化等领域。

学院拥有5个一级学科硕士授权点，包括船舶与海洋工程、水利工程、土木工程、机械工程、控制科学与工程，以及6个专业硕士学位授权点，分别是水利工程、船舶与海洋工程、建筑与土木工程、动力工程、机械工程、控制工程。学院还拥有水利工程一级学科博士授权点和水利工程博士后流动站，实力雄厚。

学院设有山东省海洋工程重点实验室、山东省海洋机电装备与仪器高校重点实验室、山东省城市与工程管理信息化高校重点实验室，以及青岛市海洋可再生能源重点实验室和青岛市海洋仪器与装备工程研究中心等科研平台。同时，学院还设有海岸与近海工程研究所、城市与工程管理信息化实验室等教学科研机构，以及建设工程检测鉴定中心、节能技术中心、行远海洋工程设计院、荣成专家工作站等社会服务机构，为学生提供多样化的学习与实践平台。