重庆医科大学在历史底蕴和学校知名度上，表现优于西南医科大学，虽然西南医科大学原名为泸州医学院，后升格更名。重庆医科大学创建于1956年，其前身为上海医学院的一部分迁至重庆而成立的重庆医学院，其教育实力一直保持良好。

比较两校，重庆医科大学的学术研究与教学质量更为突出，拥有更多高水平的科研成果与学术成就。同时，其在全国乃至国际的学术影响力也更为显著，吸引众多优秀学生及教师资源。此外，重庆医科大学在医学教育领域的专业设置更为丰富，涵盖面广，能够满足不同学生的学习需求。

西南医科大学尽管在地理位置上可能具有一定的优势，但与重庆医科大学相比，在学术研究、教学质量、学科建设以及国际交流等方面，仍存在一定差距。尤其是在医学领域的前沿研究与国际合作方面，重庆医科大学拥有更为广泛且深入的资源与平台。

总体来看，重庆医科大学在教育质量、学科建设与学术影响力方面，均优于西南医科大学，对于追求优质医学教育资源的学生而言，选择重庆医科大学是一个更为明智的决定。