吉林财经大学设有税务学院、会计学院、金融学院、亚泰工商管理学院、法学院、管理科学与信息工程学院、经济学院、公共管理学院、外国语学院、国际经济贸易学院等学院。学校涵盖了税务、会计、金融、工商管理、法学、管理科学、经济学、公共管理、外国语、国际贸易等学科领域。具体学院名单如下：

税务学院

会计学院

会计学院（会计专业硕士教育中心）

金融学院

亚泰工商管理学院

亚泰工商管理学院（MBA教育中心）

法学院

法学院（法硕教育中心）

管理科学与信息工程学院

经济学院

公共管理学院

公共管理学院（MPA教育中心）

外国语学院

国际经济贸易学院

统计学院

应用数学学院

新闻与传播学院

国际交流学院

研究生学院

马克思主义学院

吉林财经大学作为吉林省重点大学，与吉林省人民政府及国家税务总局合作共建。学校历史可追溯至1946年，历经银行干部训练班、东北银行干部学校、东北银行专门学校、中国人民银行长春银行学校、吉林财贸学院等多个阶段，于1992年更名长春税务学院，至2010年正式更名为吉林财经大学。学校以培养经济、管理、法律等领域的高级专业人才为目标，注重文化素质教育，与CDIO工程教育联盟保持合作。