南京大学在众多方面展现出更强的实力，尤其是在地理位置和经济环境方面。南京作为历史悠久的城市，拥有发达的经济和丰富的教育资源，为学生提供了更好的就业机会和发展前景。相比之下，吉林大学位于长春，虽然在某些方面表现优秀，但其地理位置和经济发展水平均不及南京，这对未来的就业造成一定影响。

在知名度方面，南京大学明显优于吉林大学。尽管吉林大学作为985院校，在合并了多个普通院校后综合排名较高，但其专业设置呈现出规模大但专业性强度不够的特点，除了车辆工程等少数专业外，多数专业水平一般。而南京大学则致力于精英教育，所开设的各个学科专业实力较强，这使得其知名度更高。

从专业实力来看，两所大学各有侧重。吉林大学在地质工程领域具有国家重点学科，表明其在这一领域有较强的实力。而南京大学在地质学方面拥有国家重点学科，这也显示出其在这一领域的深厚积淀。虽然两者在地质工程方面都有一定优势，但南大更侧重于理论研究，而吉大则更注重工程应用。

综上所述，南京大学在多个方面表现更为出色，尤其是在地理位置、经济环境、专业实力和学术声誉等方面。