12388电话举报撤销后，如果案件已经查处，那么仍然可以继续进行调查。在某些情况下，即使案件已经被撤销，相关机构仍然可能会继续调查并采取适当的行动。

具体来说，以下情况可能会导致案件被撤销但仍需继续调查：

1. 案件证据不足或不存在：如果案件的证据不足或者根本不存在，那么相关机构可能需要重新调查以确定真相。

2. 案件已过法定追诉期：如果案件已经超过法定追诉期，那么相关机构可能不会继续追究责任。

3. 当事人主动撤案：如果当事人主动向相关部门申请撤案，那么相关机构可能需要审查撤案是否真实有效。

4. 其他原因：在其他情况下，如果案件的调查结果对相关机构的决策产生影响，他们可能会要求重新调查或提供其他信息。

总之，无论案件是否被撤销，只要涉及公众利益或法律问题，相关机构通常会继续调查并采取适当的行动。如果您有任何疑问或需要更多信息，请咨询专业律师或相关机构人员。