昌吉职业技术学院提供了多种专业选择，涵盖了工程技术、信息技术、医药健康以及管理服务等多个领域。具体专业包括电气自动化技术、自动化生产设备应用、电子信息工程技术、通信技术、数字媒体应用技术、计算机网络技术、计算机信息管理、智能控制技术、移动互联应用技术、建筑工程技术、建筑经济管理、工程测量技术、建设工程监理、药学、医学检验技术、口腔医学技术、中药学、老年服务与管理等。

学院还特别注重专业建设和特色发展，其中电气自动化技术、机电设备维修与管理、电力系统自动化技术、电力系统自动化技术（清洁能源）被评定为自治区级特色专业。而机械制造与自动化焊接技术、热能动力设备与应用则作为自治区首批示范校建设的重点专业。此外，机电一体化技术专业还获得了中央财政的支持，成为高等职业院校提升专业服务能力建设的重要一环。

昌吉职业技术学院致力于为学生提供全面的专业知识和实践技能训练，以满足现代社会对各类专业人才的需求。学院的专业设置不仅紧跟时代发展的步伐，还注重理论与实践的结合，力求培养出具有创新能力和实际操作能力的高素质技术人才。

学院的教学设施先进，师资力量雄厚，能够为学生提供良好的学习环境和丰富的教学资源。同时，学院还注重与企业合作，通过校企合作项目，使学生在校期间就能接触到实际工作环境，增强他们的就业竞争力。

昌吉职业技术学院的专业设置和特色发展为学生提供了广阔的发展空间，同时也为社会培养了大量优秀的技术人才。无论是工程技术领域还是医药健康领域，学院的专业都致力于培养具有专业素养和实践能力的高素质人才。