重庆大学和吉林大学作为教育部的综合性985高校，彼此之间的实力差距并不显著。重庆大学在多个领域表现出色，特别是在建筑学、冶金工程、机械工程、土木工程、电气工程以及仪器科学与技术等方面，其在全国排名中占据了前列的位置。这些学科不仅为学生提供了丰富的学习资源，也为他们的未来职业发展打下了坚实的基础。

相比之下，吉林大学则在动物医学、数学、车辆工程、通信工程、矿业工程和医学领域具有较强的实力。这些学科的专业课程设置和研究方向，能够帮助学生深入理解相关领域的知识，培养他们在专业领域的创新能力。

然而，对于机械设计专业而言，选择重庆大学或吉林大学，并不能简单地以学校的综合排名来决定。重庆大学的机械工程专业不仅涵盖了广泛的基础知识，还提供了丰富的实践机会，使学生能够更好地将理论知识应用于实际问题解决中。而吉林大学的车辆工程专业同样值得考虑，它不仅注重基础理论教学，还强调实践与创新，为学生提供了多样化的学习体验。

因此，选择哪所学校，还需要根据学生个人的兴趣、职业规划以及对相关学科的偏好来进行。例如，如果学生对建筑设计和土木工程更感兴趣，重庆大学可能是一个不错的选择；而如果对车辆工程和通信工程更有热情，吉林大学可能更适合。

无论是重庆大学还是吉林大学，这两所高校都为学生提供了优质的教育资源和广阔的发展平台。学生可以根据自己的实际情况，做出最适合自己的选择。