丙氨酸是氨基酸中侧链最短的手性氨基酸。通过将某氨基酸残基突变为丙氨酸，可以通过考察该突变蛋白的功能是否因此突变而失去或改变，从而可以定位对该蛋白功能有关键影响的氨基酸残基，这种方法被称作“丙氨酸扫描”。例如研究丝氨酸/苏氨酸的磷酸化功能的一种手段，就是将T/S突变为A，使得该位点不能被磷酸化。

那么为什么不将其突变为甘氨酸呢？甘氨酸没有侧链，而且甘氨酸的引入比较容易改变蛋白质的构型，所以一般不采用甘氨酸。