第一、民办本科学校毕业证上写“民办”二字吗？

不会写。

第二、和普通公立高校的毕业证有什么区别？

首先，根据中华人民共和国《民办教育促进法》第四章第三十三条明确规定：“民办学校的受教育者在升学、就业、社会优待以及参加先进评选等方面享有与同级同类公办学校的受教育者同等权利。”

其次，民办大学毕业证书与全日制普通高校、自学考试等毕业证书相比有一定区别，属非公办国民教育毕业证书，本科毕业没有学位。

再者，公务员考试、司法考试等国家有特定要求须使用国民教育系列证书范畴的不能使用；但在全国范围内用于个人求职应聘、单位内部考评、定岗、晋级、涨工资、各类职业资格的中、初级考试、继续教育（如：研究生课程班）方面，在一定程度上社会认可，属于同等学历。

顺祝好运！