在选择南京大学和中山大学之间，关键因素取决于专业和个人偏好。南京大学作为C9联盟成员，综合实力略胜一筹，其排名通常在5-7之间，而中山大学则位于10名左右，南大的排名更具优势。

地理位置上，江苏省和广东省皆为经济大省，但广州与南京各有千秋。南京地处经济活跃的长三角核心地带，气候环境相对较好。学科评估方面，南京大学在第四轮评估中表现出色，A类学科数量多于中山大学，且在A+学科上更具领先地位，特别是物理、天文和地质等领域的优势更为显著。

尽管华五（包括南大）和中坚（中山）在知名度上有所差别，但两校都是985高校中的佼佼者，难以简单划分为层次。南大在华东地区可能更受欢迎，而中山大学可能在南方地区更受青睐。总体来说，选择哪所大学，应根据你的专业兴趣和个人发展需求来定，两校各有其独特的优势。