医学最好的大学排名是第一名北京协和医学院、第二名首都医科大学、第三名南方医科大学等。

一、北京协和医学院

北京协和医学院成立于1917年，中国医学科学院北京协和医学院自1957年起实行院校合一的管理体制，是我国最高医学研究机构和最高医学教育机构。院校已发展成为拥有19个研究所、6家附属医院、9个学院等，集医教研产为一体的国家级综合性医学科学研究机构。

二、首都医科大学

首都医科大学建校于1960年，是北京市重点高等院校，是北京市政府、国家卫生健康委员会、教育部共建院校。学校校本部设有11个学院、1个研究中心。学校现有全日制在校生14464人，其中研究生6023人，本科生6599人，高专高职生1139人，留学生703人；成教生2730人。

三、南方医科大学

南方医科大学是广东省高水平大学重点建设高校中唯一的医学院校，全国首批、广东省唯一一所“部委省”共建高校，全国首批开设八年制本硕博连读临床医学专业的8所高校之一。现有21个教学机构，开设本科招生专业29个，全日制本科生14129人，研究生8902人，留学生1012人。