安徽工程大学自90年代初起着手筹备计算机专业，于1992年开始招收专科生，专业名为“计算机应用”。1995年，学院正式获得了“计算机科学与技术”本科专业的招生资格，1998年5月，安徽工程科技学校计算机与信息学院正式成立。自那时以来，学院的学科专业发展迅速，2000年增设了信息与计算科学专业，2002年又增设了信息管理与信息系统专业，并在2006年获得了计算机应用技术的硕士点。

目前，学院共有在校本科学生1088人，研究生29人。自1994年至2007年，学院已经培养了13届毕业生，人数超过1500人。学院师资力量雄厚，共有教职工72人，其中专任教师64人，分为4个教研室和一个实验中心。专任教师中有5名教授和42名副高及讲师以上职称，52%的教师具备博士或硕士学位。学院教师除了负责计算机专业的教学，还负责全校计算机基础课程的教学。

学院拥有9个实验室，拥有407台计算机和106台套实验仪器，实验开出率100%，综合性、设计性实验比例高达91.5%。专业实验室二和基础实验一作为开放实验室，专业实验室一和三则同时是安徽省“双师”培训基地。此外，学院与8家公司签订校企合作协议，提供实践实习基地，满足专业实践教学需求。

近年来，依托计算机应用技术硕士点，学院建立了“图像处理与模式识别”、“软件工程与分布式计算”和“计算机网络与嵌入式系统”三个研究室。学院在全国和地方性活动中表现出色，毕业生初次就业率超过93%，考研率保持在10%左右，深受社会好评，赢得了良好的社会声誉。