在选择电气工程专业研究生院校时，中山大学由于没有设立电气工程硕士点，因此可以排除在外。对于华南理工大学和广东工业大学这两所高校，从多个维度来看，华南理工大学无疑是更好的选择。

华南理工大学在电气工程领域有着深厚的教学和研究背景，拥有一支高水平的师资队伍。该校的电气工程学科在全国第四轮学科评估中被评为A-，显示出其在该领域的领先地位。此外，华南理工大学还拥有先进的实验设备和丰富的科研资源，为学生提供了良好的学习和研究环境。

相比之下，广东工业大学虽然也在电气工程领域有所建树，但其整体实力与华南理工大学相比仍有差距。尽管广东工业大学在某些特定研究方向上也取得了一定的成就，但其在全国范围内的知名度和影响力不及华南理工大学。

此外，华南理工大学的地理位置优越，位于广州，是一座历史悠久的综合性大学。学校周围有许多企业与科研机构，为学生提供了丰富的实习和就业机会。同时，广州作为中国的南大门，具有得天独厚的地理位置优势，为学生提供了广阔的发展空间。

综上所述，对于电气工程专业的研究生来说，选择华南理工大学无疑是更加明智的决定。