这两个学校的车辆工程专业都好。

南京工程学院的车辆工程专业是该校的重点学科之一，该校在工程技术领域有较强的实力和声誉。如果对汽车设计、汽车制造、汽车工程技术等方面感兴趣，或者希望在汽车行业发展，南京工程学院的车辆工程专业可能更适合。

常州大学的车辆工程专业也是该校的重点学科之一，该校在汽车工程、机械工程等领域有较强的实力和声誉。如果对汽车动力学、汽车电子技术、汽车安全等方面感兴趣，或者希望在汽车行业发展，常州大学的车辆工程专业可能更适合。