上海工程技术大学最好的专业、王牌专业有机械工程、服装设计与工程、车辆工程、计算机科学与技术、工商管理、制药工程、环境工程、飞行技术、交通运输、化学工程与工艺等。

其中：

1、国家级一流本科专业建设点5个，分别是：车辆工程、计算机科学与技术、工商管理、制药工程、环境工程；

2、市级一流本科专业建设点有7个，分别是：自动化、旅游管理、信息管理与信息系统、高分子材料与工程、艺术与科技、飞行器制造工程、纺织工程。