自考本科与普通高考本科之间的主要区别体现在多个方面，包括文凭性质、入学方式、学制年限、招生名额以及学习形式等。

首先，文凭性质是两者最直观的区别。自考本科属于非全日制成人教育，被视为第二学历。而普通高考本科则是全日制统招形式，是第一学历。在社会上，普通本科文凭普遍受到更多认可。

其次，入学方式也有所不同。自考本科无需参加全国统一的高考，考生可以自行报名参加课程考试，通过所有课程后获得自考本科文凭。而普通高考本科则需要参加全国统一的高考，成绩达到录取分数线后才能被录取。

学制年限方面，普通高考本科通常为四年制，而自考本科的学制则较为灵活，根据考生个人进度而定，没有固定的学制年限。

在招生名额上，普通高考本科具有一定的名额限制，每年招生名额由各高校根据招生计划确定，而自考本科则没有名额限制，考生只要通过课程考试即可获得相应证书。

最后，毕业证书也有区别。普通高考本科的毕业证书上会标注“全日制”字样，而自考本科的毕业证书上则会标注“自考”字样，以此来区分两种不同的教育形式。

总之，尽管自考本科和普通高考本科在文凭性质、入学方式、学制年限、招生名额以及毕业证书方面存在差异，但它们都受到国家的认可，学信网上都能查到相关信息。