税款计算差异计入“应交税费”科目。

详细解释如下：

税款计算差异，主要是指企业在计算应缴税款过程中，由于各种原因产生的实际税款与预期税款之间的差异。这种差异可能是由于税收政策变化、会计核算方法不同或者计算过程中的误差等原因造成的。

当企业面临税款计算差异时，需要根据差异的性质和原因进行相应的会计处理。通常，这些差异会通过“应交税费”科目进行核算。“应交税费”科目主要用于记录企业应缴纳的各种税费，包括所得税、增值税、消费税等。因此，税款计算差异作为企业应缴纳税费的一部分，也应当计入此科目。

在具体操作中，企业需要根据税法规定和实际情况，对税款计算差异进行分析，确定是应补缴的税款还是可抵扣的税额。这种分析有助于企业准确核算应缴税款，并做出相应的财务决策。最后，通过“应交税费”科目进行相应的会计分录，确保税款的准确缴纳和企业的合规运营。

总之，“应交税费”科目是记录税款计算差异的关键科目，企业应当根据相关法规和实际情况，对其进行准确核算和处理，以确保企业的财务安全和合规运营。