会计师事务所的直接上级主管部门是各级财政部门，这是根据《会计师事务所执业许可和监督管理办法》的规定。此法规明确指出，财政部及省、自治区、直辖市的财政部门（简称省级财政部门）负责对会计师事务所及注册会计师的管理、监督与指导。

具体而言，各级财政部门会通过一系列制度与措施来确保会计师事务所和注册会计师的执业行为符合相关法规和职业道德标准。这些措施包括但不限于定期检查、审计、培训等，以促进会计师事务所的专业发展和提高服务质量。

财政部门的管理职能涵盖了从会计师事务所的设立、变更到注销的全过程。在设立阶段，财政部门会严格审查申请材料，确保其符合设立条件；在日常运营阶段，财政部门会定期对其进行检查，确保其合法合规；在注销阶段，财政部门会严格审查注销原因，确保其符合相关规定。

此外，省级财政部门作为地方财政部门的上级机构，还会对市级和县级财政部门的工作进行指导和支持，确保全省乃至全国范围内会计师事务所的管理水平保持一致。同时，省级财政部门也会定期汇总各地的工作情况，向上级部门汇报，并提出改进建议。

通过这种分级管理模式，财政部门能够更好地实现对会计师事务所的有效监督，提高整个行业的服务质量和职业道德水平，从而更好地服务于经济社会发展。