复杂离子自然可以有极性，本身有极性的分子，得到或失去电子形成离子之后，电荷的分布仍然不会是均匀的。

铵根离子 NH4+， sp3杂化，N-H键有极性，但由于对称，键的偶极距相互抵消，离子子本身无极性（参照甲烷）；

氢离子H3O+，sp3杂化，有一对孤对电子，结构参照氨，极性O－H键产生的偶极距无法抵消，离子有极性；

碳酸根，CO3 2－，碳是sp2杂化，由于共轭效应离子呈平面正三角形，三个C－O键实际上等价，键级均为1.33，偶极距相互抵消，离子无极性；

硫酸根，硫的杂化有争议，可能有d轨道参与成键，但硫酸根本身的构型是正四面体，偶极距相互抵消，离子无极性；

氯酸根，ClO3-, 杂化情况参照硫酸根，但由于有一对孤对电子，构型为三角锥，离子有极性。

价层电子对互斥理论（英文：Valence Shell Electron Pair Repulsion (VSEPR)），是一个用来预测单个共价分子形态的化学模型。理论通过计算中心原子的价层电子数和配位数来预测分子的几何构型，并构建一个合理的路易斯结构式来表示分子中所有键和孤对电子的位置。

价层电子对互斥理论的基础是，分子或离子的几何构型主要决定于与中心原子相关的电子对之间的排斥作用。