这里先找出与其它两个不同的-- on the phone 表示通话状态，说明说话人此时正处于通话的状态，在聊电话。

eg：turn down the TV! i am on the phone!

把电视音量关小！我正在打电话！

接下来对比下over和 through 这两个介词的不同。

首先，over phone 和by phone 的大概意思相近：通过电话，用电话 （表示一种手段）

eg：i made a booking by phone/over the phone.

我打电话（使用电话）进行了预定

再次，through the phone也表示，通过电话，但这种通过与之前的不同，through the phone 更侧重于穿过电话，隔着电话。（做某事。谈论某内容）

eg：kiss me through the phone 通过电话吻我/ 隔着电话吻我。

综上所述，推荐选through