建设厅颁发的工程师证书和人力资源和社会保障厅颁发的工程师证书确实存在一些差异。首先，颁发部门不同。建设厅的证书是由当地建设部门或相关机构负责颁发，而人力资源和社会保障厅的证书则是由国家人力资源和社会保障部门负责颁发。其次，认证标准也有所不同。建设厅颁发的证书通常是根据当地的建设行业标准进行认证，而人力资源和社会保障厅颁发的证书则是按照国家职业标准进行认证。

在认可范围方面，建设厅颁发的证书在当地的建设行业内认可度较高，而在其他行业或全国范围内可能认可度较低。相比之下，人力资源和社会保障厅颁发的证书在全国范围内都得到了广泛认可。此外，考试内容也有所不同。建设厅颁发的证书考试更侧重于建设行业的专业知识和技能，而人力资源和社会保障厅颁发的证书考试则更注重职业素质、管理知识和技能。

综上所述，尽管两个部门颁发的证书都是工程师证书，但在颁发部门、认证标准、认可范围和考试内容等方面存在差异。在选择获取证书时，个人应根据自己的需求和职业发展方向进行选择。选择适合自己的证书不仅有助于提升个人技能，也能为职业发展带来更多的机会。

值得注意的是，虽然建设厅颁发的证书在某些特定领域具备较强的专业性，但人力资源和社会保障厅颁发的证书因其全国范围的认可度，在职业发展方面具有更大的灵活性和广泛性。因此，选择哪一种证书还需根据个人的职业规划和目标进行综合考虑。

总体而言，两种证书都具有一定的价值和意义，关键在于个人如何利用这些证书来提升自己，并在职业生涯中发挥出最大的作用。无论是建设厅颁发的证书还是人力资源和社会保障厅颁发的证书，都能为持证人带来不同的职业发展机会。