上海中医药大学夜大毕业生的毕业证书通常会在大四第二学期的6月下旬发放。在这个时间段内，学校会进行毕业审核和证书制作等一系列工作，确保每位符合条件的学生都能够顺利拿到证书。7月初，学生将开始办理离校手续，正式结束夜大生活。

毕业证书的发放时间会根据地区和学校的具体情况有所差异，因此具体时间可能会有所不同。例如，上海中医药大学的夜大学毕业生一般会在6月下旬获得毕业证书，而其他地区或学校可能会有所延迟。此外，学校的教学安排、学生人数以及各种突发情况都可能影响毕业证书的发放时间。

值得注意的是，毕业证书的发放时间还与毕业生的离校时间密切相关。通常，学校会在毕业生离校前的一段时间内完成毕业证书的发放工作，以便学生能够顺利离校。因此，即使毕业证书的发放时间有所延迟，学校也会尽量确保在毕业生离校前能够完成证书发放。

总之，上海中医药大学夜大毕业证书的发放时间主要取决于学校的教学安排、地区情况以及毕业生的离校时间。为了确保顺利拿到毕业证书，学生需要密切关注学校的通知和安排，及时了解毕业证书发放的具体时间。