自学考试的毕业申请时间分为上半年与下半年，具体为6月与12月。申请上半年毕业需在5月前完成合并准考证号、转考、免考、考籍数据更正等手续；申请下半年毕业则需在11月前完成相应手续。逾期未办理者，将无法申请当次毕业。

自考毕业申请流程包括以下步骤：首先，考生需通过自学考试管理系统确认个人信息准确性，确保姓名、性别、身份证号码、电子相片及各科成绩等数据无误。随后，成功提交毕业申请后，应自行打印《毕业生登记表》。接着，在各地市规定的时间内，携带自学考试准考证、身份证原件及复印件、《毕业生登记表》（社会考生一式两份，公开（开放）学院毕业生一式三份）、前置学历毕业证书原件及复印件和如姓名或身份证号变更等原因需证明前置学历与毕业证书信息一致的公安局证明（针对申请本科毕业的考生）等材料到市、县（区）考办提交。最后，所有达到毕业要求的考生应在当地市考办规定的时间内，及时办理申请毕业登记手续，逾期者只能参加下一批次的毕业手续办理。