上海市公积金管理中心，作为直属市政府的独立事业单位，其主要职责包括：

编制、执行住房公积金的归集、使用计划。

负责记载职工住房公积金的缴存、提取、使用等情况。

负责住房公积金的核算。

审批住房公积金的提取、使用。

负责住房公积金的保值和归还。

编制住房公积金归集、使用计划执行情况的报告。

承办市政府和市住房公积金管理委员会决定的其他事项。

管理中心设13个职能处室，具体职能如下：

党委办公室(组织人事处)：起草党委工作计划和总结、负责党的组织、纪检、宣传工作、干部选拔、培训、考核、聘用、工资福利、保密、退休人员管理、工会工作及指导共青团工作。

综合秘书处：起草行政工作计划和总结、公文收发与办理、公务网管理、编制工作简报、大事记、机构财务、对外联络、接待、文书业务档案管理、物品采购、固定资产管理、会务管理、车辆管理、印信合同管理、用餐管理、文件印刷。

政策法规处：住房公积金政策法规的立法调研、起草、修改和解释、新闻宣传、政策性住房金融相关课题研究、本市住房公积金制度发展规划。

计划财务处：住房公积金、专项维修资金、售房资金等的计划管理、调度、保值增值、会计核算、财务管理、监督、考核、受托银行和单位财务管理、会计核算指导与监督。

贷款管理处：住房公积金个人贷款政策拟定、组织实施、指导、监督、检查、统计报表、信息处理、动态分析、贷后管理、保障型住房公积金贷款管理与监督。

归集管理处：住房公积金归集、提取业务管理、年度基数调整、催缴、清欠、扩大缴存覆盖面、单位降低缴存比例、缓缴住房公积金审核、受托银行归集提取业务指导、监管、考核。

纪检审计处：纪检、监察、内部审计、受托单位住房公积金业务稽查。

信息管理处：住房公积金业务信息采集、处理、维护、单位、职工公积金明细帐建立、核对、售房资金、维修资金业务处理、明细帐建立、核对、综合统计分析、季度运行分析报告编撰、业务信息查询、发布、社会相关信息收集、整理、使用、受托银行、区县管理部业务信息集中监管、信息管理工作指导。

技术开发处：计算机软件、硬件、网络运行、维护、公积金业务系统、办公自动化系统、网站系统正常工作保障、计算机应用项目开发、调试、验收、技术资料整理、归档、计算机系统配套计划和中长期发展规划编制、设备采购、验收技术支持、信息化项目预算编制。

服务管理处(信访办公室)：对外服务指导与考核、公积金受理业务管理与统计分析、公积金信访管理。

网站管理办公室：上海住房公积金网站建设、运行、管理、远程帐户信息查询、单位住房补贴资金业务办理、网上业务受理、网上服务提供、组织网上住房公积金业务培训。

执法监督处：住房公积金行政执法程序和规章制度拟定、法规政策执行情况检查监督、行政执法宣传、维权类信访协调处理、违反住房公积金法规案件立案、调查、证据制作与送达、强制执行申请、行政复议与行政诉讼应诉、区县管理部行政执法工作协调、组织。

项目管理处：廉租住房、公共租赁住房资产管理等工作。